S'établissant à Chicago, loin des factions musulmanes hostiles de Détroit, Elijah Muhammad construit ce qui devient rapidement le centre le plus important du mouvement. Chicago comporte non seulement un temple de la NOI, mais aussi un premier journal appelé The Final Call to Islam, une "université de l'islam" (une école élémentaire privé), ainsi que plusieurs entreprises : maisons de rapport, magasins, épicerie, restaurants... Progressivement, des temples sont ouverts dans d'autres villes, et des fermes rachetées, dans le but de pouvoir offrir aux membres une nourriture rituellement pure. Le mouvement a imposé des règles strictes à suivre concernant l'habillement, celui-ci devant être élégant et conservateur, la nourriture, interdiction de divers aliments, interdiction de fumer, de se droguer, de jouer aux jeux d'argent, de danser et de boire.
Elijah Muhammad a également mis à jour la théologie du mouvement. Sous son ministère, Wallace Fard Muhammad a été proclamé l'incarnation terrestre d'Allah (Dieu), Elijah Muhammad étant son prophète divinement désigné. Muhammad a également enseigné que les noirs ont constitué les êtres humains originaux, mais qu'un scientifique noir fou appelé Yakub avait créé une « bête » blanche par ses manipulations génétiques. Les blancs ont alors reçu une dispense provisoire pour régir le monde. Cette période, cependant, se termine. Le temps est venu pour que les noirs reprennent leur ancien rôle dominant. Ces caractéristiques démarquent très fortement la NOI de l'islam, au point de le rendre incompatible avec ce dernier. La guerre violente est probable avant que la transition puissent être accomplie. En attendant, Muhammad a préconisé une nation indépendante pour les afro-américains.
Il fût impliqué dans des affaires de m½urs : des rumeurs couraient depuis quelque temps sur les nombreux adultères commis par Elijah Muhammad avec de jeunes secrétaires du mouvement. Warith Deen Muhammad, le propre fils d'Elijah Muhammad, et un ami proche de Malcolm X, informa ce dernier « en 1963, que son père Elijah Muhammad avait mis enceinte six de ses secrétaires ». L'adultère est totalement contraire aux enseignements de Nation of Islam. Après avoir écarté ces informations, Malcolm X aurait fini par en obtenir confirmation en 1963. Elijah Muhammad lui-même aurait fini par indiquer qu'étant l'envoyé de Dieu sur terre, il n'était pas soumis aux même règles que le commun des mortels, et expliquant que cette activité avait pour but de suivre la lignée des prophètes bibliques.
Elijah Muhammad a également mis à jour la théologie du mouvement. Sous son ministère, Wallace Fard Muhammad a été proclamé l'incarnation terrestre d'Allah (Dieu), Elijah Muhammad étant son prophète divinement désigné. Muhammad a également enseigné que les noirs ont constitué les êtres humains originaux, mais qu'un scientifique noir fou appelé Yakub avait créé une « bête » blanche par ses manipulations génétiques. Les blancs ont alors reçu une dispense provisoire pour régir le monde. Cette période, cependant, se termine. Le temps est venu pour que les noirs reprennent leur ancien rôle dominant. Ces caractéristiques démarquent très fortement la NOI de l'islam, au point de le rendre incompatible avec ce dernier. La guerre violente est probable avant que la transition puissent être accomplie. En attendant, Muhammad a préconisé une nation indépendante pour les afro-américains.
Il fût impliqué dans des affaires de m½urs : des rumeurs couraient depuis quelque temps sur les nombreux adultères commis par Elijah Muhammad avec de jeunes secrétaires du mouvement. Warith Deen Muhammad, le propre fils d'Elijah Muhammad, et un ami proche de Malcolm X, informa ce dernier « en 1963, que son père Elijah Muhammad avait mis enceinte six de ses secrétaires ». L'adultère est totalement contraire aux enseignements de Nation of Islam. Après avoir écarté ces informations, Malcolm X aurait fini par en obtenir confirmation en 1963. Elijah Muhammad lui-même aurait fini par indiquer qu'étant l'envoyé de Dieu sur terre, il n'était pas soumis aux même règles que le commun des mortels, et expliquant que cette activité avait pour but de suivre la lignée des prophètes bibliques.
